清居堂位于翔安区马巷镇山仔尾，始建于1942年二战期间，创建人是马来西亚华侨林摘花女士(法号：莲果)。林女士原稽马巷巷东店头村人，婚后出国马来西亚槟城，因家庭变故，皈依佛教，拜槟城极乐寺广通师傅为师，法号取名“莲果”。抗战期间，莲果姑年届七旬，一心恩念家乡想要落叶归根，肩挑一担观世音菩萨像和琉璃灯行李担，飘洋过海，重归故里，出资向蔡塔购买土地。由于资金不足，莲果姑四方募化，终于一座一房二厅的堂宇落成，取名“清居堂”。

堂宇落成，莲果姑即赴莆田梅峰寺修行受戒。1954年礼聘释厚学法师登堂弘法，至此，清居堂历属原大同安梵天禅寺的下院。1959年七月莲果姑圆寂，1960年释厚学法师延请马来西亚马六甲慧慕姑（雪姑）回国接任主持。1995年雪姑往生，由梵天禅寺派僧众管理。

1999年清居堂因年久失修，在国内外善信的积极集金，要求为其翻建下， 为应广大信众的要求，油梵天寺释厚学法师代表，向同安区民宗局、同安区建设局申请翻建。并获得同安建设局发给建设工程规划许可证，建筑二层，面积共计324㎡。同时也经厦门市佛教协会、同安区佛教协会同安宗教局、同安消防大队等层层审查批准，同意翻建。1999年底动工翻建，2000年旧历6月19日，清居堂正式落成，可谓里外一新，外观小巧玲珑，庄严无比；内看金碧辉煌，整洁大方。清居堂分两层楼上供奉佛祖释迦牟尼，楼下供奉观世音大士。并由梵天禅寺住持释厚学法师续任住持，管理寺务。

2002年释厚学法师圆寂，由释厚学法师的弟子释长净法师暂为管理。2004年11月聘请释厚学法师的弟子释长如法师担任主持，管理寺务。2005年由于厦门市区规划化调整，同安分为二个行政区，清居堂归属于翔安区宗教活动场所，现有住僧众两名，坚持佛教常活动仪轨。

直至今日,，清居堂在释长如法师的管理下，整日依旧香火不断，可见香客、信徒之多，影响之广。

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